办理商标注册网上申请的，应当按以下流程办理

1、申请商标数字证书，仅商标代理组织需要进行本步骤的操作。

2、下载并安装数字证书驱动程序和安全应用控件；仅商标代理组织需要进行本步骤的操作。

3、登录网上申请系统，选择书式，提交商标网上申请。

4、缴纳商标规费，商标代理组织应当在提交申请前向商标局足额预付商标规费。

5、确认网上申请是否提交成功。提交商标网上申请后，商标局要求递交相关纸质申请材料的，应当按规定办理。