一、分公司要独立核算吗（一）分公司是不是独立核算由公司自由决定。（二）营业税或者增值税等流转税种在当地缴纳，但如果你公司跨地区注册了总分机构，所得税应当适用国税发(2008)28号文件，由总公司汇总计算，分公司按比例当地预交。（三）基于所得税汇总缴纳，你们肯定要汇总整个公司的报表，但是同时也要分开核